Bad Fischau-Brunn liegt im Industrieviertel von Niederösterreich etwa 50 km südlich von Wien am Rand des Wiener Beckens. Die Gemeinde gehört zum Gebiet des Steinfeldes an der Thermenlinie. Sie besteht aus den Katastralgemeinden Bad Fischau und Brunn an der Schneebergbahn.
Bekannt ist die Gemeinde auch wegen des denkmalgeschützten Thermalbades, das in eine schöne Parkanlage eingebettet ist.